Portal InstitucionalUFPEL

Objetivo Geral:

Esta disciplina tem como objetivo apresentar os principais tipos de marcadores e suas aplicações para estudos de biodiversidade em populações naturais e melhoramento genético em populações cultivadas.

1. Introdução: bases da herança;
2. Interpretação genética.
3. Tipos de marcadores: RFLP, RAPD, AFLP, S-SAP, SSCP, STR, ISSR, STS, SCAR, CAPS, SNP e MNLP.
4. Comparação entre diferentes tipos de marcadores: critérios de eleição, material necessário e protocolos.
5. Ligação e Recombinação
5.1 Conceito e terminologia
5.2 Cartografia de marcadores
5.3 Funções de mapeamento
5.4 Programas de mapeamento genético
6. Análise da variação genética nas populações.
6.1 Constituição genética e equilíbrio da população: cálculo das freqüências gênicas e genotípicas, HWE fatores que afetam o equilíbrio e endogamia
6.2 Variação genética e polimorfismo molecular: estrutura genética populacional, tamanho da população, gargalo de garrafa, etc
6.3 Subdivisão da variabilidade dentro e entre populações
6.4 Índices de fixação
6.5 Efeito Wahlund e fluxo gênico
7. Seleção assistida por marcadores
7.1 Marcadores diretos e indiretos
7.2 Estimação de QTL
8. Genômica

Bibliografia Básica:

• Anderson, L.; Georges, M. Domestic-animal genomics: deciphering the genetics of complex traits. Nature Reviews Genetics, London, v. 5, n. 3, p. 202-212, 2004.
• Avise, J.C. Molecular markers, natural history and evolution. 2nd Edition. Sinauer Associates, Inc, 2004.
• Beckmann, J.S.; Soller, M. Detection of linkage between marker loci and loci affecting quantitative traits in crosses between segregating populations. Theoretical Applied Genetics, Stuttgart, v. 76, n. 2, p. 228−236, 1988.
• Borém, A.; Caixeta, E.T. (Ed.). Marcadores moleculares. Viçosa: UFV, 2006. 374p.
• Dudley, J.W. Molecular markers in plant improvement: Manipulation of genes affecting quantitative traits. Crop Science, Madison, v. 33, p. 660-668, 1993.
• Eknath, A.E. Managing aquatic genetic resources. Management example 4: The Nile tilapia. In J.Thorpe, G. Gall, J.E. Lannan and C.E. Nash (eds). Conservation of fish and shellfish resources: managing diversity. Academic Press, Harcourt Brace Company, London, p. 176-194, 1995.
• Ferreira, M. E.; Grattapaglia, D. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análises genética. Brasília. 1995, 220 p.
• Gonçalves, T. M. et al. Detecção de locos de características quantitativas (QTL) afetando o crescimento e a carcaça de suínos: um enfoque Bayesiano com o uso de diferentes prioris. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 37, n. 2, p. 261-272, fevereiro 2008.
• Hartl, D.L. A Primer of Population Genetics. Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts, 1981.
• Hartl, D.L. & Clark, A.G. Principles of Population Genetics. 3rd ed., Sinauer Associates, Inc. Sunderland, Massachusetts, 1997.
• Jackson, T.R.; Martin-Robichaud, D.J.; Reith, M.E. Application of DNA markers to the management of Atlantic halibut (Hippoglossus hippoglossus) broodstock. Aquaculture, Amsterdam, v. 220, n. 1, p. 245–259, abril 2003.
• Kwok, P.Y.; Gu, Z. Single nucleotide polymorphism libraries: why and how are we building them? Molecular Medicine Today, v. 12, p. 538-543, 1999.
• Ledur, M.C.; Schimidt, G.S. Genética molecular: aplicação de tecnologias moleculares no melhoramento genético de aves http://www.bichoonline.com.br/artigos/embrapave0007.htm
• Lee, S.H; Van Der Werf, J.H.J. Simultaneous fine mapping of multiple closely linked quantitative trait loci using combined linkage disequilibrium and linkage with a general pedigree. Genetics, Baltimore, v. 173, n. 4, p. 2329–2337, agosto 2006.
• Loeschcke, V.; Tomiuk, J. & Jain, S.K. Conservation Genetics. Birkhauser Verlag, Basel, 1994.
• Tanksley, S.D.; Ganal, M.V.; Martin, G.B. Chromosome landing: a paradigm for map based gene cloning in plants with large genomes. Trends Genet. vol. 11, p.63-68, 1995.
• Switonsky, M. Molecular Genetic in beef cattle breeding – a review. Animal Science Papers and Reports, v. 20, sup. 1, p. 7-18, 2002.