Nome da Disciplina
Métodos em Filogenia Molecular
CÓDIGO
0050113
Carga Horária
34 horas
Atividade Complementar
Não
Periodicidade
Semestral
Modalidade
PRESENCIAL
Unidade responsável
CARGA HORÁRIA PRÁTICA
1
CARGA HORÁRIA TEÓRICA
1
CRÉDITOS
2
FREQUÊNCIA APROVAÇÃO
75%

Ementa

Fundamentos de evolução molecular; Marcadores moleculares; Bases dos métodos de obtenção de dados de sequências nucleotídicas: extração de DNA e RNA, purificação de ácidos nucleicos, PCR (desenho de primers e otimização da reação), clonagem, sequenciamento (Sanger e nova geração); análise de cromatogramas; Bancos de dados de sequências (NCBI e BLAST); Alinhamento de sequências; Análises preliminares: conteúdo nucleotídico, taxas de substituição, testes de saturação, seleção de modelos de substituição; Métodos e critérios para inferência/reconstrução de árvores filogenéticas: métodos baseados em matrizes de distâncias (fenética), máxima-parcimônia, máxima-verossimilhança, inferência Bayesiana; Estatística de suporte de clados; Árvores gênicas x árvores de espécies; Utilização de dados concatenados e estratégias de particionamento dos dados; Análises de estimativa de tempo de divergência; Filogenômica; Discussão sobre o uso de diferentes fontes de informação: conflitos e complementaridades.

Objetivos

Objetivo Geral:

A disciplina tem por objetivo geral fornecer aos alunos embasamento teórico e prático para a utilização de dados moleculares em análises filogenéticas. Ao final da disciplina, os alunos deverão ser capazes de tomar decisões, de maneira crítica, sobre delineamento experimental, desenho amostral, análise de dados e interpretação de resultados obtidos.

Conteúdo Programático

Bibliografia

Bibliografia Básica:

  • Felsenstein, J. 2004. Inferring Phylogenies. Sinauer Associates, Sunderland.
  • Hillis, D.M.; Moritz C.; Mable B.K. (eds.). 1996. Molecular Systematics (2a Ed.) Sinauer Associates, Sunderland.
  • Amorim, D.S. 2002. Fundamentos de Sistemática Filogenética. Ribeirão Preto: Holos, Editora e Sociedade Brasileira de Entomologia.
  • Yang, Z. 2006. Computational Molecular Evolution. Oxford Series in Ecology and Evolution. Oxford University Press, New York.
  • Matioli, S.R. (ed.). 2001. Biologia Molecular e Evolução. Holos Editora, Ribeirão Preto, SP.

Turmas Ofertadas

Turma Período Vagas Matriculados Curso / Horários Professores
01 2019 / 2 15 2 Biologia Animal (Mestrado acadêmico)
Entomologia (Mestrado acadêmico)
Fitossanidade (Doutorado)
Fitossanidade (Mestrado acadêmico)
Horários
ManhãTardeNoite
QUI14:00 - 14:50
14:50 - 15:40
MARCO ANTONIO TONUS MARINHO
Professor responsável pela turma

Página gerada em 10/12/2019 14:42:23 (consulta levou 0.117810s)