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Biología Celular y Molecular 
La biotecnología se fundamenta en los recientes conocimientos provenientes de la biología celular y molecular, posibilitando que esta tecnología se vuelva muy importante en la agricultura, no sólo en el mejoramiento de variedades o cultivares ya existentes, sino también en la obtención de nuevas plantas con características genéticas distintas y adaptadas a estreses ambientales. 

Control del Crecimiento y Desarrollo de Plantas 
El desarrollo de las plantas comprende los procesos fisiológicos de crecimiento y diferenciación. El crecimiento vegetativo de la planta abarca la germinación de las semillas, emergencia, crecimiento de la plántula, macollaje, ramificación, longevidad y senescencia de órganos o de la planta. Mientras tanto, el crecimiento reproductivo parte de la inducción, evocación e iniciación floral, crecimiento y amarre del fruto, y crecimiento y madurez del fruto. De esa exposición sumaria, se percibe que todos los procesos están integrados, influyendo en el rendimiento de la planta. Los aspectos morfológicos y los sistemas de regulación (metabólica, hormonal y ambiental) del desarrollo de plantas agriculturables están relacionados con la cantidad y la calidad de los productos empleados. Las especies y los cultivares utilizados en los agroecosistemas de la región presentan los más variados problemas de crecimiento, desarrollo y comportamiento frente a las condiciones del medio.

Fisiología de Semillas
La semilla es el principal medio de multiplicación de varias especies cultivadas y silvestres. El rendimiento agrícola está condicionado a la disponibilidad de semillas de alta calidad genética y fisiológica y elevada pureza física. El empleo de la siembra de semillas de alta calidad es fundamental para la obtención de una elevada productividad. La identificación de los problemas que interfieren en la calidad de las semillas se reviste de gran significado técnico-científico y económico.

Nutrición Mineral y Metabolismo de las Plantas
La producción vegetal es dependiente de substancias obtenidas del ambiente, como agua, oxígeno, carbono y sales minerales; asimismo influyen directamente en ella los factores energéticos, como radiación solar y temperatura. La absorción y la utilización de la energía regulan los procesos constructivos y de mantenimiento de los vegetales. Las tasas fotosintéticas y respiratorias determinan la asimilación líquida, que orienta la producción primaria (biomasa), que, por su turno, se expresará en la producción económica. Esta línea de investigación se encuentra sostenida por proyectos relacionados principalmente a la fotosíntesis, estreses ambientales y metabolismos de los principales nutrientes.

Productividad, Translocación y Partición de Asimilados
La productividad de una cultura depende de una serie de interrelaciones complejas entre plantas individuales, una comunidad de plantas y el medio ambiente. Esas relaciones de conformidad con el potencial genético se manifiestan por medio de procesos fisiológicos, que resultan en el crecimiento y desarrollo de las plantas.

Relación de Asignaturas – 1º Semestre

Ácidos Nucleicos: Estructura y Regulación
Bioquímica Vegetal I
Biotecnología Vegetal: Cultura de Células y Tejidos de Plantas
Crecimiento y Desarrollo de Plantas
Prácticas de Docencia Orientada
Experimentación Vegetal
Laboratorio de Fisiología Vegetal II
Marcadores Moleculares en Plantas
Investigación en Fisiología Vegetal
Principios y Aplicaciones de la Electroforesis
Problemas Especiales en Fisiología Vegetal
Seminario en Fisiología Vegetal

Relación de Asignaturas – 2º Semestre

Aspectos Fisiológicos de la Nutrición Mineral
Anatomía Vegetal
Bioquímica Vegetal II
Físico-Química Aplicada a la Fisiología Vegetal
Fisiología de la Producción
Fisiología del Estrés
Fisiología de Semillas
Laboratorio de Fisiología Vegetal I
Metabolismo de Plantas
Investigación en Fisiología Vegetal
Relación Agua-Planta
Seminario en Fisiología Vegetal
Transformación Genética y Caracterización Molecular de Plantas

Biología Celular y Molecular 
Eugenia Jacira Bolacel Braga
José Antonio Peters
Valmor João Bianchi

Control del Crecimiento y Desarrollo de Plantas 
Eugenia Jacira Bolacel Braga
Antonio Peters
Valmor João Bianchi
Leonardo Dutra

Fisiología de Semillas
Dario Munt de Moraes

Nutrición Mineral y Metabolismo de las Plantas
Luciano do Amarante
Marcos Antonio Baccarin
Sidnei Deuner

Productividad, Translocación y Partición de Asimilados
Profesores que orientan en esta línea de investigación
Marcos Antonio Baccarin
Sidnei Deuner