Nome do Projeto
Desenvolvimento de uma ferramenta para montagem e anotação automatiza de genomas procariotos
Ênfase
PESQUISA
Data inicial - Data final
20/05/2014 - 12/12/2016
Unidade de Origem
Coordenador Atual
Área CNPq
Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Resumo
Com o advento das modernas plataformas de sequenciamento de DNA (NGS), o volume de dados gerados em projetos genoma cresceu substancialmente, assim como a complexidade para análise dos mesmos. Desta forma, diferentes softwares são utilizados em etapas de pré-processamento dos dados, montagem de novo, mapeamento de leituras (reads) de sequenciamento, ordernamento de contigs, predição de genes e anotação funcional, o que dificulta o gerenciamento dos dados e das ferramentas, ainda mais por usuários com pouca experiência em informática. De forma a facilitar estes processos, o presente trabalho visa desenvolver uma ferramenta que integre estes softwares, otimizando e facilitando os processos de montagem e anotação de genomas.
Objetivo Geral
Desenvolvimento de uma pipeline integrada para montagem e anotação de genomas procariotos de fácil utilização.
Equipe do Projeto
| Nome | CH Semanal | Data inicial | Data final |
|---|---|---|---|
| ALAN JOHN ALEXANDER MCBRIDE | 2 | 20/05/2014 | 12/12/2016 |
| FREDERICO SCHMITT KREMER | 4 | 20/05/2014 | 12/12/2016 |
| LUCIANO CARLOS DA MAIA | 2 | 20/05/2014 | 12/12/2016 |
| MARCUS REDÜ ESLABÃO | 4 | 20/05/2014 | 12/12/2016 |
| MONIZE NAKAMOTO PROVISOR SANTOS | 4 | 20/05/2014 | 12/12/2016 |
| ODIR ANTONIO DELLAGOSTIN | 2 | 20/05/2014 | 12/12/2016 |
| RAFAEL DOS SANTOS WOLOSKI | 4 | 20/05/2014 | 12/12/2016 |