Nome do Projeto
Desenvolvimento de uma ferramenta para montagem e anotação automatiza de genomas procariotos
Ênfase
PESQUISA
Data inicial - Data final
20/05/2014 - 12/12/2016
Unidade de Origem
Área CNPq
Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Resumo
Com o advento das modernas plataformas de sequenciamento de DNA (NGS), o volume de dados gerados em projetos genoma cresceu substancialmente, assim como a complexidade para análise dos mesmos. Desta forma, diferentes softwares são utilizados em etapas de pré-processamento dos dados, montagem de novo, mapeamento de leituras (reads) de sequenciamento, ordernamento de contigs, predição de genes e anotação funcional, o que dificulta o gerenciamento dos dados e das ferramentas, ainda mais por usuários com pouca experiência em informática. De forma a facilitar estes processos, o presente trabalho visa desenvolver uma ferramenta que integre estes softwares, otimizando e facilitando os processos de montagem e anotação de genomas.

Objetivo Geral

Desenvolvimento de uma pipeline integrada para montagem e anotação de genomas procariotos de fácil utilização.

Equipe do Projeto

NomeCH SemanalData inicialData final
ALAN JOHN ALEXANDER MCBRIDE220/05/201412/12/2016
FREDERICO SCHMITT KREMER420/05/201412/12/2016
LUCIANO CARLOS DA MAIA220/05/201412/12/2016
MARCUS REDÜ ESLABÃO420/05/201412/12/2016
MONIZE NAKAMOTO PROVISOR SANTOS420/05/201412/12/2016
ODIR ANTONIO DELLAGOSTIN220/05/201412/12/2016
RAFAEL DOS SANTOS WOLOSKI420/05/201412/12/2016

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