Nome do Projeto
SEQUENCIAMENTO E ANÁLISE DO TRANSCRIPTOMA DE Conyza bonariensis SENSÍVEL E RESISTENTE AO GLIFOSATO ATRAVÉS DE FERRAMENTAS DE RNA-Seq
Ênfase
PESQUISA
Data inicial - Data final
10/03/2017 - 09/03/2021
Unidade de Origem
Coordenador Atual
Área CNPq
Ciências Agrárias - Agronomia - Matologia
Resumo
Plantas daninhas são historicamente um sério problema agrícola, pois interferem com as culturas e reduzem significativamente o rendimento biológico e econômico. No atual cenário da agricultura global muitas espécies de plantas daninhas têm apresentado resistência aos herbicidas, dentre elas a buva (Conyza spp.). Em ambientes agrícolas a buva foi a primeira espécie magnoliopsida a apresentar resistência ao glifosato, sendo atualmente uma das invasoras resistentes mais amplamente dispersas no mundo. O mecanismo de resistência ao herbicida glifosato em buva não envolve genes codificadores da enzima EPSPS, tendo uma provável alteração nos processos bioquímicos. Os locais ou enzimas que comumente estão associados com a resistência não relacionada ao local de ação do herbicida são o citocromo P450s, glutationa S-transferases (GSTs), glicosiltransferases (GTs), e transportadores ABC. No entanto, a nível global, poucos estudos discutem qual o verdadeiro mecanismo que confere a resistência ao glifosato em buva. Dessa forma, a identificação de genes com expressão diferencial que conferem a resistência ao glifosato não estando relacionados ao sítio de ação herbicida pode possibilitar melhor entendimento do processo e auxiliar no desenvolvimento de novas formas de manejo. O sequenciamento e caracterização do transcriptoma de buva através da metodologia do RNA-Seq pode ser decisiva neste processo, pois oferece algumas vantagens em relação aos métodos tradicionais, uma delas é a não necessidade de um genoma padrão já sequenciado da espécie. O objetivo do trabalho será caracterizar o transcriptoma de C. bonariensis sensível e resistente ao glifosato com a metodologia de RNA-Seq, buscando elucidar o processo da resistência não relacionada ao local de ação do herbicida. A presente pesquisa tem o intuito de melhorar o conhecimento sobre a buva e auxiliar no desenvolvimento de ferramentas para facilitar seu manejo, aumentando a sustentabilidade da atividade agrícola.

Objetivo Geral

Realizar o sequenciamento e caracterização genética do transcriptoma de Conyza bonariensis sensível e resistente ao glifosato através da metodologia do RNA-Seq;
Fazer a comparação do perfil de transcrição de Conyza bonariensis sensível e resistente ao glifosato com auxílio de ferramentas de bioinformática e bioestatística;
Identificar genes marcadores da resistência ao glifosato que não estejam relacionados ao local específico de ação do herbicida;
Desenvolver iniciadores (primers) específicos como forma de validar os marcadores previamente identificados através de RT-qPCR;
Desenvolver um kit de identificação rápida de resistência de buva ao glifosato.

Equipe do Projeto

NomeCH SemanalData inicialData final
CRISTIANO PIASECKI810/03/201709/03/2021
EDINALVO RABAIOLI CAMARGO110/03/201709/03/2021
JOANEI CECHIN110/03/201709/03/2021
JONAS RODRIGO HENCKES110/03/201709/03/2021
JOSÉ VITOR SILVA DA SILVA110/03/201709/03/2021
LUCIANO CARLOS DA MAIA110/03/201709/03/2021
LUIS ANTONIO DE AVILA110/03/201709/03/2021
MAICON FERNANDO SCHMITZ110/03/201709/03/2021

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