Nome da Atividade
BIOINFORMÁTICA
CÓDIGO
22000616
Carga Horária
45 horas
Tipo de Atividade
DISCIPLINA
Periodicidade
Semestral
Modalidade
PRESENCIAL
Unidade responsável
CARGA HORÁRIA TEÓRICA
2
CARGA HORÁRIA EXERCÍCIOS
1
CARGA HORÁRIA OBRIGATÓRIA
3
CRÉDITOS
3
FREQUÊNCIA APROVAÇÃO
75%

Ementa

Treinamento na utilização de bancos de dados de DNA e Proteínas;
Seqüenciamento de DNA, análise de sequências e montagem de contigs;
Utilização do BLAST, COG, SMART, PFAM e outras ferramentas para análise de genes e genomas;
Utilização de softwares de análise de sequências para construção de novas moléculas, mapa de restrição e desenho de primers;
Treinamento na utilização do software Vector NTI® e todas as suas funções;
Filogenia molecular.

Objetivos

Objetivo Geral:

x

Conteúdo Programático

Introdução à Bioinformática
Noções básicas sobre o que é bioinformática.
Acesso a dados de sequências moleculares e literatura
Apresentação dos principais bancos de dados dados e estratégias para extração da informação desejada. (teoria e prática)
Sequenciamento de DNA e montagem de contigs - ContigExpress
Alinhamento de sequências
Alinhamento de sequências sob a perspectiva evolucionária. Descrição dos algoritmos de alinhamento par-a-par. (teoria e prática)
Buscas de sequências homólogas em bancos de dados
BLAST e PSI-BLAST (teoria e prática)
Utilização do Vector NTI®, mapas de restrição, desenho de primers
Utilização do Vector NTI® - construção de moléculas
Buscas de sequências homólogas em bancos de dados (continuação; prática)
Alinhamento múltiplo de sequências (teoria e prática)
Artemis e WebACT
Filogenia molecular (teoria e prática)
Análise de proteínas
Famílias de proteínas e a natureza modular das proteínas (domínios e motivos).
Propriedades físicas das proteínas e como acessar essas características (Interpro, Pfam, SMART, Prodom, etc).(teoria e prática)

Bibliografia

Bibliografia Básica:

  • Pevsner, J. (2009) Bioinformatics and Functional Genomics- 2ª Edition, Wiley-Blackwell, New York, USA
  • Lesk, A. M. (2008) Introdução à Bioinformática - 2ª Edição, Artmed. Porto Alegre.
  • Bergeron, B.P.(2002) Bioinformatics Computing. Prentice Hall, New York. USA
  • Vector NTI 11.0 User's Manual. (2009). Invitrogen, USA
  • http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez
  • http://www.expasy.org/

Turmas Ofertadas

Turma Período Vagas Matriculados Curso / Horários Professores
T1 2026 / 2 15 9 Biotecnologia (Doutorado)
Biotecnologia (Mestrado acadêmico)
Fitossanidade (Mestrado acadêmico)
Horários
ManhãTardeNoite
QUI14:00 - 14:50
14:50 - 15:40
16:00 - 16:50
LUCIANO DA SILVA PINTO
Professor responsável pela turma

Disciplinas Equivalentes

Disciplina Curso
BIOINFORMÁTICA Biotecnologia (Mestrado acadêmico)
BIOINFORMÁTICA Biotecnologia (Doutorado)

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