Nome da Atividade
BIOINFORMÁTICA
CÓDIGO
22000616
Carga Horária
45 horas
Tipo de Atividade
DISCIPLINA
Periodicidade
Semestral
Modalidade
PRESENCIAL
Unidade responsável
CARGA HORÁRIA TEÓRICA
2
CARGA HORÁRIA EXERCÍCIOS
1
CARGA HORÁRIA OBRIGATÓRIA
3
CRÉDITOS
3
FREQUÊNCIA APROVAÇÃO
75%
Ementa
Treinamento na utilização de bancos de dados de DNA e Proteínas;
Seqüenciamento de DNA, análise de sequências e montagem de contigs;
Utilização do BLAST, COG, SMART, PFAM e outras ferramentas para análise de genes e genomas;
Utilização de softwares de análise de sequências para construção de novas moléculas, mapa de restrição e desenho de primers;
Treinamento na utilização do software Vector NTI® e todas as suas funções;
Filogenia molecular.
Seqüenciamento de DNA, análise de sequências e montagem de contigs;
Utilização do BLAST, COG, SMART, PFAM e outras ferramentas para análise de genes e genomas;
Utilização de softwares de análise de sequências para construção de novas moléculas, mapa de restrição e desenho de primers;
Treinamento na utilização do software Vector NTI® e todas as suas funções;
Filogenia molecular.
Objetivos
Objetivo Geral:
xConteúdo Programático
Introdução à Bioinformática
Noções básicas sobre o que é bioinformática.
Acesso a dados de sequências moleculares e literatura
Apresentação dos principais bancos de dados dados e estratégias para extração da informação desejada. (teoria e prática)
Sequenciamento de DNA e montagem de contigs - ContigExpress
Alinhamento de sequências
Alinhamento de sequências sob a perspectiva evolucionária. Descrição dos algoritmos de alinhamento par-a-par. (teoria e prática)
Buscas de sequências homólogas em bancos de dados
BLAST e PSI-BLAST (teoria e prática)
Utilização do Vector NTI®, mapas de restrição, desenho de primers
Utilização do Vector NTI® - construção de moléculas
Buscas de sequências homólogas em bancos de dados (continuação; prática)
Alinhamento múltiplo de sequências (teoria e prática)
Artemis e WebACT
Filogenia molecular (teoria e prática)
Análise de proteínas
Famílias de proteínas e a natureza modular das proteínas (domínios e motivos).
Propriedades físicas das proteínas e como acessar essas características (Interpro, Pfam, SMART, Prodom, etc).(teoria e prática)
Noções básicas sobre o que é bioinformática.
Acesso a dados de sequências moleculares e literatura
Apresentação dos principais bancos de dados dados e estratégias para extração da informação desejada. (teoria e prática)
Sequenciamento de DNA e montagem de contigs - ContigExpress
Alinhamento de sequências
Alinhamento de sequências sob a perspectiva evolucionária. Descrição dos algoritmos de alinhamento par-a-par. (teoria e prática)
Buscas de sequências homólogas em bancos de dados
BLAST e PSI-BLAST (teoria e prática)
Utilização do Vector NTI®, mapas de restrição, desenho de primers
Utilização do Vector NTI® - construção de moléculas
Buscas de sequências homólogas em bancos de dados (continuação; prática)
Alinhamento múltiplo de sequências (teoria e prática)
Artemis e WebACT
Filogenia molecular (teoria e prática)
Análise de proteínas
Famílias de proteínas e a natureza modular das proteínas (domínios e motivos).
Propriedades físicas das proteínas e como acessar essas características (Interpro, Pfam, SMART, Prodom, etc).(teoria e prática)
Bibliografia
Bibliografia Básica:
- Pevsner, J. (2009) Bioinformatics and Functional Genomics- 2ª Edition, Wiley-Blackwell, New York, USA
- Lesk, A. M. (2008) Introdução à Bioinformática - 2ª Edição, Artmed. Porto Alegre.
- Bergeron, B.P.(2002) Bioinformatics Computing. Prentice Hall, New York. USA
- Vector NTI 11.0 User's Manual. (2009). Invitrogen, USA
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez
- http://www.expasy.org/
Turmas Ofertadas
| Turma | Período | Vagas | Matriculados | Curso / Horários | Professores | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| T1 | 2026 / 2 | 15 | 9 |
Biotecnologia (Doutorado) Biotecnologia (Mestrado acadêmico) Fitossanidade (Mestrado acadêmico) Horários
|
LUCIANO DA SILVA PINTO Professor responsável pela turma |
Disciplinas Equivalentes
| Disciplina | Curso |
|---|---|
| BIOINFORMÁTICA | Biotecnologia (Mestrado acadêmico) |
| BIOINFORMÁTICA | Biotecnologia (Doutorado) |