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El Centro de Biotecnología (Cenbiot) de la Universidad Federal de Pelotas (UFPel) fue inaugurado en noviembre de 1988. Desde su creación, el Cenbiot ha crecido constantemente, volviéndose en un centro de diseminación de conocimientos de la moderna biotecnología, de generación de tecnología y de formación de nuevos investigadores en UFPel. La experiencia acumulada por los investigadores reunidos en el Cenbiot, a través de diversos proyectos de investigación desarrollados y de su actuación en los distintos cursos de Posgrado en el área de Ciencias Agrarias de la UFPel, proporcionó la creación, en 1994, del Programa de Posgrado en Biotecnología (PPGBiotecnología), que ofrece un curso de doctorado. El programa se dirigía principalmente para el provecho de los estudiantes originados de los cursos de maestría de las Ciencias Agrarias de UFPel y se pretendía a capacitarlos en la aplicación de técnicas de la moderna biotecnología en sus campos de estudios. Tras una reestructuración, restringiendo la concentración de las líneas de investigación al área de Ciencias Agrarias, el Programa empieza a llamarse Programa de Posgrado en Biotecnología Agrícola y a ofrecer cursos de maestría y doctorado en Biotecnología Agrícola. En 2008, con la creación del comité de Biotecnología, por la CAPES (Coordinación de Perfeccionamiento de Personal de Nivel Superior), el programa retoma su nombre, Programa de Posgrado en Biotecnología. Desde su creación, el Programa ya ha formado 53 maestros y 90 doctores, muchos de los cuales se han vuelto profesores y/o investigadores de instituciones nacionales e internacionales de enseñanza e investigación. Actualmente, el Programa está vinculado al Centro de Desarrollo Tecnológico (CDTec) de la UFPel, Núcleo de Biotecnología, con sede en el Campus Capão do Leão, S/N, edificio 19, CP 354, CEP 96010-900, Pelotas, RS, Brasil. Además de la maestría y doctorado, el Núcleo de Biotecnología del CDTec ofrece también la Licenciatura en Biotecnología, el primer curso de Grado en Biotecnología del estado de Rio Grande do Sul.

En 2013, tras la evaluación trienal (2010-2012) realizada por la CAPES, el PPGBiotecnología conquistó la calificación 6, volviéndose parte del selecto grupo más conceptuado del país. En esa evaluación, los programas evaluados recibieron calificaciones en la siguiente escala: 1 y 2, que inhabilitan el programa; 3, que significa rendimiento regular, atendiendo a un patrón mínimo de calidad; 4, que es considerado un buen rendimiento; y 5, que es la calificación máxima para programas que ofrecen sólo maestría. Calificaciones 6 y 7 señalan un rendimiento equivalente al alto patrón internacional.

Actualmente, el Programa es coordinado por los profesores Dr. Fabricio Rochedo Conceição (coordinador) y Dr. Alan John Alexander McBride (coordinador adjunto). En el cuerpo docente colaboran 26 investigadores, de los cuales 70% son becarios de productividad científica o tecnológica del CNPq (Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico). El grupo ha estado captando expresivos recursos financieros de agencias de fomento a la investigación (CNPq, CAPES, FAPERGS y FINEP) y de otras fuentes, como el Ministerio de la Salud, el Ministerio de la Agricultura, Pecuaria y Abastecimiento, la Petrobrás, entre otras, lo que ha estado posibilitando la publicación de artículos científicos en revistas de excelencia en el área, el desarrollo de procesos y productos biotecnológicos (patentes), la cualificación de los discentes y la modernización de su infraestructura. El Programa mantiene sociedades con grupos de investigación exponentes en el país y en el mundo, posee laboratorios bien estructurados y equipados y presenta una excelente relación entre docentes, discentes y jefaturas.

La finalidad del Programa es la formación de recursos humanos para la enseñanza, extensión e investigación capaces de llevar a cabo proyectos de investigación científica, incluyendo aspectos de planeamiento, delineamiento, ejecución, análisis y publicación, así como el desarrollo de procesos y productos, contribuyendo con el avance del conocimiento científico y tecnológico en Biotecnología.

El Programa oferta diversas asignaturas básicas (Bioquímica, Biología Celular, Biología Molecular, Microbiología, Inmunología, Biometría y Experimentación, Metodología en Investigación) y aplicadas (Bioseguridad, Inmunodiagnóstico, Técnicas en Biología Molecular, Bioinformática, Biotecnología Vegetal, Biotecnología Ambiental, Marcadores Moleculares, Bacterias Patogénicas de Alimentos, Tecnología de las Fermentaciones, Animales de Laboratorio, Embriología Molecular y Transgénesis Animal, Criopreservación de Gametos y Embriones, Genómica Funcional, Emprendedorismo y Propiedad Intelectual, Seminarios, Docencia Orientada). Para la obtención del título de Maestro o Doctor, además de la defensa de la tesis de maestría o doctorado, el alumno necesita obtener 20 créditos en la Maestría y 40 en el Doctorado.